Sur la bonne voie pour éliminer l'une des maladies infectieuses les plus importantes - le paludisme

Stratégie de mise en œuvre du diagnostic moléculaire LAMP au Sénégal

Le Sénégal s'attaque au paludisme avec l'outil de diagnostic avancé LAMP, réduisant les cas de 38 % et les décès de 7,1 % entre 2015 et 2019. LAMP améliore la précision du diagnostic et soutient le Plan stratégique national 2021-2025, en particulier dans les régions à forte charge de paludisme telles que Kolda, ce qui est essentiel pour le contrôle de la qualité et l'investigation des cas.

Le paludisme est endémique dans tout le Sénégal et 100 % de la population est exposée au risque de la maladie.

The number of malaria cases declined by 38% from 2015–2019 (from 69 per 1000 population to 50) and the number of malaria deaths decreased by 7.1% in the same period (from 0.30 per 1000 population to 0.28)¹. Cela a été possible grâce à l'adoption de plusieurs stratégies, notamment le diagnostic par des tests rapides et un ensemble de protocoles de test et de traitement à l'échelle de la population².

Suite à ce succès, le Programme National de Lutte contre le Paludisme (PNLP) a réorienté sa stratégie de contrôle vers l'élimination et s'est associé aux parties prenantes pour mener des recherches sur la mise en œuvre de stratégies d'élimination potentielles dans différents contextes de transmission afin d'informer le plan stratégique national de lutte contre le paludisme.

En avril 2021, un nouvel outil de diagnostic moléculaire (LAMP) a été mis en œuvre dans le cadre d'un effort supplémentaire pour atteindre le Plan stratégique national (PSN) 2021-2025 du Sénégal pour l'élimination du paludisme.

Situation épidémiologique du paludisme au Sénégal

Le fardeau du paludisme au Sénégal est encore inégalement réparti, avec un taux de transmission plus faible dans la partie nord du pays. Trois régions, Kolda, Tambacounda et Kédougou, sont les plus touchées.

- 11% de la population générale

- 83% des cas de paludisme confirmés, tous âges confondus

- 90% des cas chez les enfants de moins de 5 ans

- 90% des cas chez les femmes enceintes.

- 51% des décès tous âges confondus

- 73% des décès chez les enfants de moins de 5 ans

La morbidité proportionnelle du paludisme est passée de 1,90 % en 2015 à 1,09 % en 2020, soit une réduction de 42,4 %. La mortalité proportionnelle due au paludisme a diminué de 1,90 % en 2015 à 1,01 % en 2020, soit une réduction de 46,7 %³.

Incidence du paludisme pour 1000 habitants à risque en 2019 (source PNLP)

Incidence du paludisme pour 1000 habitants à risque en 2020 (source PNLP)

Malaria-LAMP : comment fonctionne-t-il ?

L'amplification isotherme en boucle (LAMP) est une technique moléculaire récemment développée qui a été conçue pour surmonter les difficultés rencontrées avec les outils de diagnostic existants en étant une méthode plus simple et plus rapide que la microscopie tout en offrant un niveau élevé de précision par rapport aux tests rapides.

La limite de détection est de 1 à 2 parasites/µL, ce qui est bien inférieur à la microscopie et aux TDR. En outre, Malaria-LAMP peut différencier les espèces de Plasmodium pan, P. falciparum et P. vivax, et a une sensibilité de 84-94%, une spécificité de >92%⁴.

Ce test peut servir de norme de référence dans les environnements aux ressources limitées et d'outil de surveillance et de dépistage lorsqu'un test très sensible est nécessaire. Le flux de travail peut être réalisé en quelques étapes et permet une extraction facile de l'ADN et la préparation des mélanges réactionnels, le tout dans un seul instrument sans nécessiter d'équipement supplémentaire.

Par rapport à la PCR, la Malaria-LAMP a un temps de réponse plus court (45 min), un coût plus faible et les résultats sont visibles à l'œil nu sous une lumière LED bleue. Le stockage et l'expédition des réactifs se font à température ambiante, ce qui convient aux zones rurales disposant d'un environnement limité.

Projet pilote pour la mise en œuvre du programme Malaria-LAMP

Un projet pilote de trois ans a été lancé à l'automne 2021 pour réduire l'écart de précision de la détection des cas de paludisme dans les sites où la prévalence est plus faible.

Financé par la banque islamique et avec le soutien technique et les conseils de Human Diagnostics Allemagne, 30 unités de HumaLoop M ont été achetées, ainsi que les différents kits de détection, afin de pouvoir effectuer un total de 58 000 tests au cours de la première année.

« Programme « Former les formateurs

Un certain nombre de membres du personnel des laboratoires ont reçu un programme personnalisé de « formation des formateurs » qui leur permettra d'assurer la formation du reste du personnel dans les laboratoires de district où Humaloop M a été mis en place.

Calendrier du projet

Le projet est prévu pour une durée de 3 ans. Une évaluation finale sera réalisée à la fin de la période d'essai.

Au cours de la prochaine phase, d'autres instruments HumaLoop M seront installés dans d'autres sites au Sénégal.

Une formation de remise à niveau a été organisée par les responsables du PLNP afin de les sensibiliser à la technologie LAMP et aux instructions d'utilisation.

Photos : Dakar Sénégal avril 2021 - Lancement officiel du projet pilote Malaria-LAMP

Lignes directrices et objectifs du PNLP pour 2021-2025

Le Sénégal est en train de mettre à jour ses politiques et directives nationales conformément à l'objectif d'élimination du paludisme d'ici 2025.

Le renforcement du processus de décentralisation par la mise en place de plans régionaux de lutte contre le paludisme est l'une des principales approches stratégiques adoptées par le gouvernement.

L'utilisation de la biologie moléculaire dans les zones à faible prévalence pour le diagnostic, l'intensification du contrôle transfrontalier et l'amélioration des projets permettront d'accélérer la lutte contre le paludisme dans les zones sud et est du pays.

En juin 2021, le PNLP a publié une directive nationale actualisée pour l'utilisation du diagnostic moléculaire LAMP (Loop-Mediated isothermal Amplification) dans les hôpitaux de district.

L'utilisation de la technique « LAMP » est indiquée dans les situations suivantes :

Pour le contrôle de la qualité de la microscopie et des TDR : compte tenu de la sensibilité, les prestataires peuvent demander l'utilisation de cet outil pour évaluer la qualité des résultats des frottis microscopiques et des tests de diagnostic rapide.
Pendant les enquêtes sur les cas, sur la base de l'approche de confirmation avant le Focal Screening Test and Treat (FSTAT) ou le Focal Test and Treat (FTAT) est un outil d'administration de médicaments communément appelé le test des facteurs de risque.
En cas de discordance entre le TDR et la microscopie dans le diagnostic biologique des cas en routine, l'outil « LAMP » est indiqué pour avoir un résultat de meilleure qualité.
En cas de forte suspicion de paludisme avec un résultat négatif au TDR ou à la microscopie (routine).

Bibliographie

1. Severe Malaria observatory extension of Medicines of Malaria ventures.

2. Sophie Faye, corresponding author 1 Altea Cico, 1 Alioune Badara Gueye, 2 Elaine Baruwa, 1 Benjamin Johns, 1 Médoune Ndiop, 2 and Martin Alilio 3 Scaling up malaria intervention “packages” in Senegal: using cost effectiveness data for improving allocative efficiency and programmatic decision-making Malar J. 2018; 17: 159.

3. PNLP (Programme National de Lutte contre le Paludisme- PNLP).

4. Mohon AN, Getie S, Jahan N, et al. Ultrasensitive loop mediated isothermal amplification (US-LAMP) to detect malaria for elimination. Malar J. 2019;18(1):350.